Unika Atma Jaya merupakan buah gagasan
yang dibahas pada rapat para Uskup se-Jawa pada Juni 1952. Dalam
pertemuan itu diutarakan kemungkinan pembentukan suatu perguruan tinggi
Katolik di Indonesia. Di Jakarta gagasan itu terwujud sejak didirikannya
Yayasan Atma Jaya oleh sekelompok cendekiawan muda Katolik pada tanggal
1 Juni 1960. Yayasan inilah yang kemudian mendirikan sebuah perguruan
tinggi Katolik dengan nama Universitas Katolik Indonesia Atma Jaya.
Mereka antara lain: Ir. J.P. Cho, Ir. Lo Siang Hien-Ginting, Drs. Goei
Tjong Tik, I.J. Kasimo, J.B. Legiman, S.H., Drs. F.X. Seda, Pang Lay
Kim, Tan Bian Seng, Anton M. Moeliono, St. Munadjat Danusaputro, J.E.
Tan, Ben Mang-Reng Say.
Pada tahun-tahun awal, Unika Atma Jaya
dibantu oleh para suster Ursulin, dengan menyediakan ruang kuliah di
kompleks persekolahan Ursulin, di Jalan Lapangan Banteng Utara dan
kompleks Santa Theresia, Menteng. Sejak tahun 1967, Atma Jaya
berangsur-angsur menempati kampus di Jalan Sudirman yang terkenal dengan
nama kampus Semanggi. Selanjutnya menempati kampus Pluit, di Jakarta
Utara untuk Fakultas Kedokteran (FK), Rumah Sakit Atma Jaya (RSA), dan
Rumah Duka Atma Jaya.
Atma Jaya berarti Rohlah yang jaya. Roh
yang jaya memberi semangat untuk selalu meningkatkan mutu pendidikan.
Keunggulan akademis dan lulusan professional adalah orientasi utama.
Kini, Unika Atma Jaya telah memiliki
delapan fakultas dengan tujuh belas program studi untuk program sarjana
(S1) dan Program Pasca Sarjana dengan tujuh program magister: Magister
Manajemen (MM) dan Magister Linguistik Terapan Bahasa Inggris (LTBI)
pada tahun 1992, Magister Profesi Psikologi pada 2005, Magister
Bioteknologi pada 2011, Magister Sains Psikologi, Magister Ilmu Hukum
pada 2012 dan Magister Teknik Mesin pada 2013 serta satu program doktor
Linguistik Terapan Bahasa Inggris (LTBI) pada tahun 2002. Untuk program
sarjana (S1): Fakultas Ekonomi (FE) dan Fakultas Ilmu Administrasi
Bisnis dan Ilmu Komunikasi (FIABIKOM) berdiri pada tahun 1960, Fakultas
Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP) dan Fakultas Teknik (FT) tahun 1961,
Fakultas Hukum (FH) tahun 1965, Fakultas Kedokteran (FK) tahun 1967,
Fakultas Psikologi (FP) tahun 1992 dan Program Magister Profesi
Psikologi tahun 2005, serta Fakultas Teknobiologi (FTb) tahun 2002.
